domingo, 3 de junio de 2012

PORTADA


SEP                       SNEST                          DGEST


INSTITUTO TECNOLÓGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO


 PRESENTA: ULISES SAMERON FARIAS

UNIDAD VIIII

“TRANSFERENCIA DEL MATERIAL GENÉTICO”

No DE CONTROL: 09930082

CARRERA: LIC. EN BIOLOGIA

VI SEMESTRE

CIUDAD ALTAMIRANO GRO. MÉXICO A 03 DE junio DEL 2012



miércoles, 30 de mayo de 2012

CONCLUSIONES.


En esta unidad número 8 como en muchas otras unidades que hemos vistos asido muy interesante, ya que pudimos entender los procesos de la regulación de expresión genética, como se lleva a cabo, donde ocurre, que factores intervienen en esos procesos, en cuál de los organismos es más sencilla y donde es más complicado o complejo.

8.3 REGULACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN EN ORGANISMOS EUCARIÓTICOS.


Los tipos de señales que pueden alterar la transcripción de un gen puede ser:

Señales hormonales:

Que interaccionan con un receptor de la membrana. En la mayoría de los casos, la señal externa provoca la aparición del segundo mensajero intracelular. La cascada de transducción de señal subsiguiente produce un regulador de transcripción específico. 



PROTEÍNAS QUE MODULAN LA TRANSCRIPCIÓN

En eucariotas, pueden actuar como reguladores tanto moléculas de RNA como proteínas. Entre las proteínas, las hay que forman parte de la holoenzima polimerasa (los factores de transcripción), otras intervienen en la remodelación de la cromatina y un tercer grupo se une al DNA para regular la transcripción, que es el que nos ocupa.

1.- ACTIVADORES TRANSCRIPCIONALES

Los activadores son la proteínas que se van a unir a los elementos distales (SDE y potenciadores) para activar la transcripción.




2.- COACTIVADORES Y CORREPRESORES

La acción de un activador de transcripción (o de un represor) puede ejercerse directamente sobre el complejo basal (bien sobre la RNA-polimerasa, alguno de los TFII o los TAFII), o a través de una molécula intermediaria que puede ser un coactivador o un correpresor.
Se denomina coactivador si ayuda a activar la transcripción. Un mismo coactivador puede recibir señales de distintos activadores para transmitirlos hacia el complejo del promotor basal.

3.- TRANSACTIVADORES

Son aquellos que directamente ejercen su acción interaccionando con el complejo de iniciación formado en el promotor basal, bien sobre la propia polimerasa o, más normalmente, sobre una de las TAF o de los TFII, para activar o reprimir la transcripción, puesto que no son actividades excluyentes.

Potenciadores


La fuente de regulación más potente es al de los elementos distales: los potenciadores (enhancers o intensificadores). Su función es la de amplificar la transcripción del promotor incluso más de 1000 veces.

Silenciamiento de genes

La unión inespecífica de proteínas reguladoras es un problema importante en los organismos con genomas grandes. Para combatirla, los eucariotas han hecho que los genes tengan en torno a 5 dianas para proteínas reguladoras diferentes. Esta estrategia es útil para los activadores de la transcripción porque es una estrategia eficiente y ahorra esfuerzo. Una estrategia similar no es factible con los inhibidores de la transcripción, por lo que se da poca regulación por silenciamiento.


Inactivación mediante una proteína reguladora


Se consigue uniendo una proteína reguladora a cualquiera de los distintos elementos que forman los promotores.


PTGS: silenciamiento génico postranscripcional


Consiste en la degradación específica de los mRNA complementarios de una de las hebras del dsRNA. Los mRNA degradados suelen ser transcritos aberrantes de diversos orígenes. También se denomina cosupresión o extinción (quelling).

Silenciamiento por metilación

No todos los organismos tienen el DNA metilado. En los mamíferos, el DNA metilado forma heterocromatina a la que no pueden acceder los factores de transcripción. Por tanto, los genes metilados no se pueden transcribir ni tan siquiera residualmente. Se trata de un mecanismo muy eficiente de silenciamiento génico que, además, disminuye la cantidad de DNA que los factores de transcripción y la RNA-polimerasa tienen que rastrear para buscar los promotores.




8.4.2 OPERON DE TRIPTOFANO.


El operón triptófano (operón trp) es un sistema de tipo reprensible, ya que el aminoácido triptófano (Correpresor) impide la expresión de los genes necesarios para su propia síntesis cuando hay niveles elevados de triptófano. Sin embargo, en ausencia de triptófano o a niveles muy bajos se transcriben los genes del operón trp. Los elementos del operón trp son en esencia semejantes a los del operón lactosa:

·         Genes estructurales: existen cinco genes estructurales en el siguiente orden trpE-trpD-trpC-trpB-trpA.

·         Elementos de control: promotor (P) y operador (O). El promotor y el operador están al lado de los genes estructurales y en el siguiente orden: P O trpE-trpD-trpC-trpB-trpA. Curiosamente, las enzimas codificadas por estos cinco genes estructurales actúan en la ruta metabólica de síntesis del triptófano en el mismo orden en el que se encuentran los genes en el cromosoma.

·         Gen regulador (trpR): codifica para la proteína reguladora. Este gen se encuentra en otra región del cromosoma bacteriano aunque no muy lejos del operón.

·         Correpresor: triptófano.

En el siguiente esquema se indican los elementos del Operón Triptófano:



OPERÓN TRIPTÓFANO: EN AUSENCIA DE TRIPTÓFANO

En ausencia de triptófano, o cuando hay muy poco, la proteína reguladora producto del gen trpR no es capaz de unirse al operador de forma que la ARN-polimerasa puede unirse a la región promotora y se transcriben los genes del operón triptófano.


OPERÓN TRIPTÓFANO: EN PRESENCIA DE TRIPTÓFANO.

En presencia de triptófano, el triptófano se une a la proteína reguladora o represora cambiando su conformación, de manera que ahora si puede unirse a la región operadora y como consecuencia la ARN-polimerasa no puede unirse a la región promotora y no se transcriben los genes estructurales del operón trp.

Por tanto, la diferencia esencial entre el operón lac (inducible) y el operón trp (represible), es que en este último el represor del triptófano solamente es capaz de unirse al operador cuando previamente está unido al trp.
Al estudiar más profundamente el operón trp se encontró que además del mecanismo de regulación represor-operador existía otro mecanismo de regulación que se denominó regulación por atenuación.


BIBLIOGRAFÍA:

  • www.itescam.edu.mx/principal/sylabus/fpdb/recursos/r46453.PDF
  • antología de biología molecular.







8.2.1 OPERON DE LACTOSA (CONTROL POSITIVO).


Jacob, Monod y colaboradores analizaron el sistema de la lactosa en E. coli, de manera que los resultados de sus estudios permitieron establecer el modelo genético del Operón que permite comprender como tiene lugar la regulación de la expresión génica en bacterias.
Un Operón es grupo de genes estructurales cuya expresión está regulada por los mismos elementos de control (promotor y operador) y genes reguladores.

LOS PRINCIPALES ELEMENTOS QUE CONSTITUYEN UN OPERÓN SON LOS SIGUIENTES:

v  Los genes estructurales: llevan información para poli péptidos. Se trata de los genes cuya expresión está regulada. Los operones bacterianos suelen contener varios genes estructurales, son poligénicos o policistrónicos. Hay algunos operones bacterianos que tienen un solo gene estructural. Los operones eucarióticos suelen contener un sólo gen estructural siendo monocistrónicos.

v  El promotor (P): se trata de un elemento de control que es una región del ADN con una secuencia que es reconocida por la ARN polimerasa para comenzar la transcripción. Se encuentra inmediatamente antes de los genes estructurales. Abreviadamente se le designa por la letra P.

v  El operador (O): se trata de otro elemento de control que es una región del ADN con una secuencia que es reconocida por la proteína reguladora. El operador se sitúa entre la región promotora y los genes estructurales. Abreviadamente se le designa por la letra O.

v  El gen regulador (i): secuencia de ADN que codifica para la proteína reguladora que reconoce la secuencia de la región del operador. El gen regulador está cerca de los genes estructurales del operón pero no está inmediatamente al lado. Abreviadamente se le denomina gen i.

v  Proteína reguladora: proteína codificada por el gen regulador. Está proteína se une a la región del operador.

v  Inductor: sustrato o compuesto cuya presencia induce la expresión de los genes.


El Operón lactosa, que abreviadamente se denomina Operón lac, es un sistema inducible que está bajo control negativo, de manera que la proteína reguladora, producto del gen regulador i, es un represor que impide la expresión de los genes estructurales en ausencia del inductor. El inductor del sistema es la lactosa. Como veremos más adelante, el operón lac también está bajo control positivo, ya que existe otra proteína  que estimula la transcripción de los genes estructurales.


Los genes estructurales del operón lactosa son los siguientes:

 v  El gen z+: codifica para la  βββ-galactosidasa que cataliza la hidrolisis de la lactosa en glucosa más galactosa.
 v  El gen y+: codifica para la  galactósido permeasa que transporta  β-galactósidos al interior de la célula bacteriana.
 v  El gen a+: codifica para la tiogalactósido transacetilasa que cataliza la transferencia del grupo acetil del acetil Coenzima A al 6-OH de un aceptor tiogalatósido. Este gen no está relacionado con el metabolismo de la lactosa.

OPERÓN LACTOSA EN AUSENCIA DE LACTOSA
Sin embargo, en presencia del inductor (la lactosa), este se une a la proteína reguladora que cambia su conformación y se suelta de la región operadora dejando acceso libre a la ARN polimerasa para que se una a la región promotora y se transcriban los genes estructurales. Por consiguiente, la presencia del inductor hace que se expresen los genes estructurales del operón, necesarios para metabolizar la lactosa.


OPERÓN LACTOSA EN PRESENCIA DE LACTOSA
También es conveniente recordar que los tres genes  estructurales del operón lactosa se transcriben juntos en un mismo ARNm, es decir que los ARN mensajeros de bacterias suelen ser  policistrónicos, poligénicos o multigénicos. Sin embargo, en eucariontes los mensajeros suelen ser  monocistrónicos o mono génicos, es decir, corresponden a la transcripción de un solo gen estructural.


OPERÓN LACTOSA: ARNM MULTIGÉNICO O POLICISTRÓNICO


BIBLIOGRAFIA:

  • www.itescam.edu.mx/principal/sylabus/fpdb/recursos/r46453.PDF
  • antología de biología molecular.










martes, 29 de mayo de 2012

8.2 REGULACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN EN ORGANISMOS PROCARIÓTICOS.


La regulación de la síntesis de proteínas ocurre a nivel de la transcripción y es una consecuencia de la interacción entre el ambiente químico de la bacteria y proteínas codificadas por genes reguladores. Estas proteínas pueden funcionar como controles negativos, reprimiendo la transcripción del mRNA, o como controles positivos, intensificándola.

LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION EN ORGANISMOS PROCARIOTICOS ESTA REGULADA POR LOS SIGUIENTES MECANISMOS:

CAMBIOS EN LA ESTRUCTURA DEL DNA

METILACIÓN:

La metilación provoca un cambio de estructura en el apareamiento entre las bases nitrogenadas que puede alterar su reconocimiento por algunas proteínas. El más conocido es el de la metilasa dam que reconoce la secuencia GATC y metila la A.
La mayor parte de los genes cuya expresión se ve reprimida por la metilación son genes cuya expresión sólo se necesita durante la replicación (único momento en el que una cadena del DNA está transitoriamente hemimetilado), permaneciendo reprimidos el resto del ciclo celular.

SUPERENROLLAMIENTO:

Para mantener una situación homeostática en la célula en relación al número de superenrollamientos es necesario mantener con una regulación contraria los genes topA (codifica la topoisomerasa I) y gyrA y gyrB (determinan las dos subunidades de la DNA-topoisomerasa II). No se conot;; mso-fareast-language: ES;">Lo provocan aquellos cambios que, sin alterar ni la estructura del DNA ni la de la RNA-polimerasa, sí que afectan la interacción entre ambas. Es necesaria la comparecencia de una tercera molécula, habitualmente una proteína (aunque a veces puede ser RNA). Tres mecanismos pueden alterar esta interacción:

•          Modificación de la interacción entre RNA polimerasa y el promotor debido a la existencia de una proteína reguladora y un efector. Lo provocan aquellos cambios que, sin alterar ni la estructura del DNA ni la de la RNA-polimerasa, sí que afectan la interacción entre ambas. Es necesaria la comparecencia de una tercera molécula, habitualmente una proteína (aunque a veces puede ser RNA). Tres mecanismos pueden alterar esta interacción:

•          Modificación de la interacción entre RNA polimerasa y el promotor debido a la existencia de una proteína reguladora y un efector.
•          Secuencias reguladoras a distancia.
•          Modificación de la terminación: anti terminación.

BIBLIOGRAFIA:


Antología biología molecular

8.1 NIVELES DE REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GENÉTICA.


A nivel de la regulación en  la expresión de los genes, La estrategia procariota pretende alcanzar las máximas tasas de proliferación cuando el entorno se lo permita. En cambio, la estrategia eucariota ha de ser distinta puesto que en los organismos pluricelulares donde el medio intercelular es relativamente constante, el control génico está al servicio de la especialización celular.

La genómica parece indicar que:

1.- el número de genes no varía mucho entre las especies: los vertebrados tienen como mucho el doble de genes que los invertebrados;

2.- el número de genes no sirve para explicar la diversidad evoultiva por mutación o duplicación génica;

3.- la variabilidad de los genes se debe a la duplicación de genes en vez de la creación de genes nuevos.

4.- la complejidad evolutiva se correlaciona con el aumento de genes reguladores: en las levaduras hay un gen regulador por cada 20 funcionales, pero en humanos hay más de 3 000 reguladores para unos 30 000 genes. 

NIVELES DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN EUCARIONTES

Las diferentes posibilidades de regulación de la expresión génica en organismos eucariotas son:

I. Nivel de cromatina

II. Nivel transcripcional

III. Nivel postranscripcional

IV. Nivel traduccional

V. Nivel postraduccional

La regulación génica es un proceso muy complejo que puede llevarse a cabo a varios niveles:

      1.    Sobre la cromatina: zonas transcripcionalmente activas vs. Zonas silentes
       2.    Sobre la transcripción: iniciación, sitios alternativos de iniciación, splicing.

Por eso, la complejidad de los organismos emerge de una regulación de la expresión génica cada vez más elaborada y no de cambios o mutaciones en los genes estructurales o enzimáticos: la secuencia de las proteínas se conserva mucho a través de distintas especies, sin cambios importantes mientras que los cambios en el orden de los elementos del promotor o de sus elementos reguladores provocan alteraciones drásticas.