Al igual que en procariotas, las etapas básicas son:
1° etapa- iniciación.
2° etapa- elongación.
3° etapa- terminación.
1° ETAPA- INICIACIÓN:
Los genes de eucariotas, al igual que los de procariotas, precisan de
promotores para iniciar la transcripción.
Durante la iniciación es cuando
se produce el reconocimiento del promotor y asociación de la polimerasa. Es la
parte más compleja de la transcripción y sobre la que se ejercerán la mayoría
de las actividades reguladoras.
La función del promotor es, esencialmente,
facilitar la unión de la RNA-polimerasa al DNA y asegurar que el inicio de la
transcripción se realice muy eficazmente y en un nucleótido determinado. El
complejo de iniciación produce en la región de inicio de transcripción el
desenrollamiento y separación de las dos cadenas del DNA (complejo abierto)
que es donde va a tener lugar la síntesis de la cadena de RNA.
Cada RNA-polimerasa reconoce un
promotor específico y forma un complejo holoenzimático polimerasa diferente y
característico.
2° ETAPA- ELONGACIÓN:
La holoenzima ha permanecido
inmóvil mientras se polimerizan los primeros nucleótidos, hasta que el TFIIK
fosforila el CTD, activado por el TFIIE. Tras la fosforilación, la polimerasa
se libera de todos los factores de iniciación excepto la helicasa del TFIIF y
comienza su avance por el DNA. En torno al elemento Inr pueden quedarse los
TFII A, B y D así como otros activadores de la transcripción, listos para
reiniciar otro ciclo de transcripción —esta vez más abreviado puesto que las
primeras estapas no han de repetirse.
3° ETAPA- TERMINACIÓN:
- detención o pausa en el avance de la polimerasa al pasar por ellas.
- desestabilización del híbrido RNA—DNA.
El resultado final es la separación
de los componentes del complejo de transcripción y desensamblaje de la
holoenzima para ser reciclada en otro complejo de iniciación. El extremo 3’ de
los RNA eucarióticos transcritos no coincide con el extremo 3’ de los RNA
maduros ya que es habitual que los extremos de los transcritos primarios se
corten durante la maduración (excepto los de la RNA-polimerasa III). También se
comprende la dificultad del estudio de las secuencias y mecanismos de
terminación, ya que los transcritos primarios (hnRNA y otros pre-RNA) son de
corta vida y difícil purificación.
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